あらすじ「薔薇の乙女・ナナセ」の魂のかけらをまた一つ集め、元の世界へ戻った風間七瀬。そんな七瀬を狙い、何者かが現れた。間一髪、相棒の黒猫・シャルルの機転で逃げ出した七瀬だったが、シャルルは酷い怪我を負ってしまう。そんな中、シャルルは「ある秘密」を七瀬に語る。それは、七瀬が以前から感じていた疑問を明らかにしてくれたが、あまりにも悲しい真実でもあった。一方で、ナナセリオン城ではユーリ達が深刻な話をしていた。するとそこに「あるはずのないもの」が急に現れ――?