高校生・天宮晴輝の住む町は、ある日突然、人を襲う“保菌者”によって埋め尽くされてしまった…。蠢く大量の“保菌者”から逃げ切れるのか!? 絶望的サバイバル、開幕! 変わり果てた人間が町を襲い、変わり果てた町が人を阻む!! いつもの道を、命を懸けて駆け抜けろ!
脱出作戦当日──海兵隊に包囲される道の駅駐車場組。轟は“二心同体”でエリックを抑え、ながみが一人保菌者と戦っていた。だが保菌者は進化を続け…3体の強力な個体がながみを襲う! 救援に向かう晴輝も、強烈な蹴りを放つ新型保菌者に追い詰められていた。人々の情報を得て、進化を続ける保菌者。秋保という“実験場”から逃れられるのか!?