高校生・天宮晴輝の住む町は、ある日突然、人を襲う“保菌者”によって埋め尽くされてしまった…。蠢く大量の“保菌者”から逃げ切れるのか!? 絶望的サバイバル、開幕! 変わり果てた人間が町を襲い、変わり果てた町が人を阻む!! いつもの道を、命を懸けて駆け抜けろ!
世界へと拡散した感染。晴輝を救うため隊長代行だと嘘をついた紗月は、その言葉と作戦で皆の心をつかんでいく。「雪玉作戦」は一晩で東北全域を安全地帯とすることに成功した。一方、金平総理の前には死んだはずの天宮螢が! 仲間の力を借りて危機を脱し、犯人を倒すため3つの作戦を提示する。その鍵となるのは…隔離地域の天宮晴輝!!