NCT研究所陥落を阻止したものの、遺産の情報を奪われてしまった由宇たち。失意の由宇をあざ笑うかのように黒川は暗躍する。驚異の遺産の力、マモンの頭脳、黒川の謀略の前に、遺産犯罪組織や国家はあまりにも無力だった。 神出鬼没に世界各地の違法遺産開発機関を黒川は攻撃する。多数の死者が出る一方、世論は黒川を英雄視する向きも出てくる。心揺らぐ由宇だったが、そんな彼女を闘真と麻耶は励ますのだった。 そして…。アメリカ第四艦隊が沈没したフリーダムをサルベージしようとするこの時、由宇たちはここを決戦の場に選んだ。世界最高峰の頭脳と冷酷な悪魔の最後の戦いが、ついに始まった!