尊敬していた亡き双子の兄・八尋に代わり、『怪盗』 を目指す杉崎渉。イリーガルの組織 『マスカレード・サーカス』 による森ノ宮学院襲撃から 『神器』 を守った渉とスバルと朝宮の三人は《シャッタード・スリー》と呼ばれ、学内でも称えられていた。その功績もあり、1年生代表の優秀生(セレクト)に選ばれた渉とスバルは、「御三家」 の音井と風祭、そして優秀生の中でも実力者の渋谷とともに新たな怪盗ミッションへと挑むことになるのだが……。 『マスカレード・サーカス』 にも匹敵する新たな組織 『コープス』 も現れ、争いが激化していく怪盗界。その未来は── !?