あらすじ『蛇遣い』との戦闘の果てにトワを奪還したレイジ達は、巽の計らいで沖縄から一路本州へ。しかし期待を裏切られ到着した場所は京都の西都防衛学院だった。しかも到着早々に西都の生徒会長兼問題児の橘イオリに何故か絡まれてしまい落ち着けない。一方、彼らと時同じくしてトワを狙う新たな追手が、武装中学生達と、この千年の都に再び闘争の記憶を呼び覚まそうとしていた--。古都を舞台に贈る戦場のボーイ・ミーツ・ガール、待望の第二弾が登場!