「もしかしたらネウロイとわかり合えるかもしれない」人型のネウロイと遭遇し、その行動に今までとは違う何かを感じた芳佳だったが、そんな彼女をミーナは軍規違反として謹慎処分にしてしまう。どうしても自分が感じたものが何なのか確かめたい芳佳は、基地を抜け出し、一人ネウロイの巣へと向かうのだが!? 扶桑で芳佳の帰りを待つみっちゃんの妄想全開（？）な書き下ろしオリジナルエピソードも追加！ アニメ２期放映！
全巻(1-4巻 完結)
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ストライクウィッチーズ 乙女ノ巻
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ストライクウィッチーズ 乙女ノ巻３
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