帝都発空襲!ドーリットル隊の東京直接空襲に帝国海軍は震撼した。日本本土へ肉薄するハルゼィ機動部隊に立ち向かうは装甲空母“関ヶ原”ただ一隻。真珠湾での傷を癒した“関ヶ原”は錨を上げ、アメリカ艦隊へと突進を開始した。菊の御紋章を持たぬ民間空母のオーナーは『那覇ドック』社長・轟木真之助。彼は未来を垣間見た者としての責務を果たすべく、横須賀と神戸で暗躍を続ける。そして運命のミッドウェー海戦が勃発!帝国日本海軍を待ち受ける敵将スプルーアンス提督率いるアメリカ空母部隊。空母四隻を引き連れた山口多聞少将は用兵の妙を見せ、敵を屠るも、やはり悪しき歴史は繰り返した。この事態に装甲空母“関ヶ原”はどう動くのか?そして山本五十六大将直率の戦艦“大和”は間に合うのか!?初夏のミッドウェー沖に日米両軍の死闘が展開する…。