シジフォスの罠とは知らずに進化科学研究所へ侵入し、囚われの身となってしまったイサミ。彼を盾にして企業体エイジア総帥カース＝マハールは地球改造計画（テラフォーミング・プロジェクト）への「目覚めたる脳（ハイパー・ブレイン）」の協力をレンに迫る。そのころ、国連事務総長は国連軍を率いてエイジアの本拠地・地底王国（ジオ・キングダム）をレンもろともに攻撃する決意をし、それを聞いたセラはレン救出のためにアリシマ・グループの私設軍を率いて地底王国へ突入する決定をした。地球と人類、すべての運命の鍵を担わされてしまった少年レンが選ぶ道は!?

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