「ゴッドイーター」の特殊部隊「ブラッド」から初の戦死者が出た。隊長のジュリウスは、隊を離脱して無人型の「神機兵」の開発にまい進することを宣言する。以降、神機兵の活躍が目立つようになり、ゴッドイーターたちのアラガミ討伐任務は減っていく。さなか、隊員ロミオの命を奪ったアラガミ「マルドゥーク」の根城が判明。ブラッドとジュリウスは、討伐へ向かう。しかし、野営中のテントが襲われ、回復錠や投与用の偏食因子が焼失。ブラッドたちは、アラガミ化をはらんだ
時間制限付きでマルドゥークと戦うことになった……。緊迫の「マルドゥーク編」と、コミカルな「聖なる探索編」を収録!