数多の武芸者が”最強”を求め命を懸けた伝説の武芸仕合『海原大仕合』から2年。『海原大仕合』で天下無双と謳われた千石伊織の元に徳川幕府より、戦いへの誘いが届く。敵は幕府が”最強”を決めるため選んだ武芸者たち、その名は”幕下百剣”。伊織に付き従うのは、剣に魅せられた一ノ瀬家の娘・蘭。いずれも一騎当千の強者たちを相手に、千石伊織の新たな戦いが幕を開ける!!
ついに再会した我間と直善! 直善はなぜ無宝流と行動を共にするのか? 直善が我間に託す最後の願いとは!? 我間に大きな決断の時が迫る! 一方、かつて無宝流の重鎮だった東条春嶽は幕府が遣わした手練れ・蔵院聖矢と激突! 陰謀渦巻く情勢のなか、東条は己の進む道を決断する!